2016年04月12日
国がんなど、肝臓がん日本人300例の全ゲノム解読
【カテゴリー】:ファインケミカル
【関連企業・団体】:なし

国立がん研究センター(国がん)は12日、理化学研究所、東京大学、広島大学、日本医療研究開発機構の共同研究グループが、日本人300例の肝臓がんの全ゲノムシーケンス解析を実施し、それらのゲノム情報をすべて解読したと発表した。単独のがん種の全ゲノムシーケンス解析数としては世界最大規模となる。

この研究は、国際がんゲノムコンソーシアム(ICGC)のプロジェクトの一環として行われ、単独のがん種の全ゲノムシーケンス解析数としては世界最大規模となる。日本では、年間約4万人が肝臓がんと診断され、3万人以上が亡くなっている。とくに、日本を含むアジアで発症頻度が高く、主な原因は肝炎ウイルスの持続感染である。B型(HBV)やC型肝炎ウイルス(HCV)の感染に伴う慢性肝炎から、肝硬変を経て、高い確率で肝臓がんを発症する。

今回、共同研究グループは、日本人300例の肝臓がんの腫瘍と正常DNA(デオキシリボ核酸)の全ゲノムの塩基配列情報を次世代シーケンサー(NGS)と東京大学医科学研究所附属ヒトゲノム解析センターのスーパーコンピュータで解読し、がん細胞のゲノム変異を網羅的に解析した。データ総量は、約70兆個もの塩基配列情報にのぼった。その結果、ゲノム異常は1つの腫瘍当たり平均で約1万カ所であった。既知のがん関連遺伝子のゲノム構造異常に加えて、新規のがん遺伝子のゲノム構造異常、HBVとアデノ随伴ウイルスの肝臓がんゲノムへの組み込み、遺伝子発現に影響を及ぼす可能性のある非コード領域や非コードRNAの変異も多数検出された。また、臨床背景と相関する新たな変異的特徴(シグネチャー)も同定された。これらは、肝臓がんの発生や進行に深く関与するとみられる。これらのゲノム情報によって肝臓がんは6つに大きく分類され、肝臓がん術後生存率はこの分子分類によって異なることもわかった。

今回の成果は、今後、がんのゲノム配列情報に基づいた肝臓がん治療の個別化や新規の治療法・予防法開発へ発展する可能性がある。

同成果は、国際科学誌「Nature Genetics」4月12付に掲載される。